Après la mort de Geese Howard dans le Fatal Fury original , un mystérieux noble devient le sponsor du nouveau tournoi "King of Fighters". Cette fois, le tournoi se déroule partout dans le monde avec des combattants du monde entier en compétition. Au fur et à mesure que le joueur progresse, le challenger mystérieux commence à vaincre les participants du premier jeu Fatal Fury, à la recherche de l'homme responsable de la défaite de Geese.
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