Shugo Chara! Doki! est la deuxième saison de Shugo Chara! et commence à l'épisode 52. Amu est la fille "cool et rebelle" de son école, tellement qu'elle en est intouchable. Cependant, cette attitude n'est qu'une façade créée involontairement. Un soir, elle prie sa personnalité de revenir ; mais à la place, naissent trois Shugo Chara, contenant chacun une personnalité différente qui est aussi une partie de celle d'Amu ! Amu entre dans le groupe des gardiens après avoir découvert que seuls les enfants possédants un Shugo Chara en font partie. C'est là que commence la quête de l'embryon, l'uf capable d'exaucer n'importe quel vu ! En effet, la mission des gardiens est de retrouver cet uf. Mais d'autres personnes veulent l'embryon (la compagnie Easter) et la quête se transforme généralement en combat contre les agents d'Easter quand ceux-ci se rencontrent. L'année passe, Kukai et Nadeshiko s'en vont et sont remplacés par Rima et Sanjou. Peu après, un quatrième uf éclot, mais un X se déposera sur celui-ci...
